Шведские пресноводные бактерии раскрывают утраченные гены и неожиданные способности к фотосинтезу

Бактерии — одни из самых разнообразных и древних форм жизни на Земле. Однако большая часть того, что мы о них знаем, относится к небольшой группе видов, изученных в основном из-за их роли в здоровье человека.

«Подавляющее большинство видов бактерий остаётся неизученным, и это действительно ограничивает наше понимание того, как бактерии формируют экосистемы и эволюционировали, чтобы выживать в различных средах», — говорит Йоэль Халлгрен, ведущий автор исследования.

Большинство бактерий размножаются путём простого симметричного деления клеток. Однако представители одной отличительной группы, Caulobacterales, известные своим «стебельчатым» внешним видом, отклоняются от этого правила. У них более сложный жизненный цикл, включающий асимметричное деление клеток, в результате которого образуются два различных типа клеток: одна подвижная и исследовательская, а другая — неподвижная и репродуктивная.

Эволюционные причины, стоящие за этим сложным жизненным циклом, давно озадачивали учёных. Известно, что бактерии Caulobacterales широко распространены в окружающей среде и считаются важными разрушителями растительного вещества в природе, но их экология и эволюция оставались малоизученными.

Исследователи из Стокгольмского университета проанализировали ДНК всех известных видов Caulobacterales, включая недавно собранные образцы из шведских и финских лесных озёр. Их выводы были опубликованы в журнале Nature Communications.

Они обнаружили, что у нескольких пресноводных видов отсутствует более ста генов, обычно связанных со сложным жизненным циклом группы.

Эти бактерии представляют три новых вида в ранее неизвестном роде, который команда назвала Acaudatibacter, что на латыни означает «бактерия без хвоста».

Интересно, что другой представитель Caulobacterales, выделенный в почве в Эквадоре, также лишён того же набора генов жизненного цикла и, как наблюдали исследователи с помощью микроскопии, размножается путём простого симметричного деления клеток. Эта независимая утрата сложности в отдельных линиях даёт представление о наборе генов, необходимых для сложных жизненных циклов бактерий.

«Удивительно видеть, что эволюция неоднократно меняла сложность жизненного цикла одинаковым образом», — говорит Йоэль Халлгрен. «Это даёт нам уникальную генетическую подпись того, как сложность возникает и исчезает в ходе эволюции жизненных циклов бактерий».

Исследователи также сделали ещё одно неожиданное открытие: шведские озёрные бактерии обладают всеми генами, необходимыми для фотосинтеза, способность, ранее неизвестная у Caulobacterales. Это подчёркивает, что фотосинтез более распространён среди бактерий, чем считалось ранее. Дальнейший анализ показал, что примерно 10% видов в этой группе несут гены для улавливания световой энергии.

«Волнительно, что новые виды бактерий из моей родной страны дают нам новые перспективы на фундаментальные концепции в микробиологии», — говорит Халлгрен.

Исследование было результатом тесного междисциплинарного сотрудничества между двумя исследовательскими группами Стокгольмского университета, обе из которых базируются в SciLifeLab, национальной инфраструктуре для биологических наук, когда работа началась.

«Этот проект объединил экспертизу моей лаборатории в области биологии бактериальных клеток и генетики с сильными знаниями группы Сары Гарсии в области микробиальной геномики и экологии», — говорит старший автор Кристина Йонас.

Предоставлено Стокгольмским университетом.

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте