Более 300 человек из научных кругов и промышленности собрались в аудитории, чтобы посетить семинар BoltzGen в четверг, 30 октября, организованный Клиникой машинного обучения в здравоохранении Абдул Латиф Джамиль (MIT Jameel Clinic).
Главным докладчиком мероприятия стал аспирант Массачусетского технологического института и первый автор BoltzGen Ханнес Стёрк, который объявил о BoltzGen всего за несколько дней до этого.
Основываясь на Boltz-2
Boltz-2 — это модель с открытым исходным кодом для прогнозирования биомолекулярных структур, предсказывающая аффинность связывания белков, которая летом произвела фурор. BoltzGen — первая модель такого рода, которая пошла ещё дальше, генерируя новые белки-связывающие вещества, готовые войти в процесс поиска лекарств.
Работа представлена на препринт-сервере bioRxiv.
Три ключевых инновации делают это возможным:
1. Способность BoltzGen выполнять различные задачи, объединяя проектирование белков и прогнозирование структуры, сохраняя при этом современный уровень производительности.
2. Встроенные ограничения BoltzGen разработаны с учётом обратной связи от сотрудников лабораторий, работающих в мокрых условиях, чтобы гарантировать, что модель создаёт функциональные белки, которые не противоречат законам физики или химии.
3. Строгий процесс оценки проверяет модель на «не поддающихся лечению» мишенях заболеваний, расширяя возможности генерации связывающих веществ BoltzGen.
Большинство моделей, используемых в промышленности или научных кругах, способны либо прогнозировать структуру, либо проектировать белки. Более того, они ограничены генерацией определённых типов белков, которые успешно связываются с лёгкими «мишенями».
Потенциал BoltzGen
Parabilis Medicines, один из отраслевых партнёров, тестировавших BoltzGen в условиях мокрой лаборатории, высоко оценил потенциал BoltzGen: «Мы считаем, что внедрение BoltzGen в нашу существующую вычислительную платформу для пептидов Helicon обещает ускорить наш прогресс в создании революционных лекарств против серьёзных заболеваний человека».
Открытые релизы BoltzGen
Открытые релизы Boltz-1, Boltz-2 и теперь BoltzGen (который был представлен на седьмой конференции по молекулярному машинному обучению 22 октября) открывают новые возможности и прозрачность в разработке лекарств, а также сигнализируют о том, что биотехнологической и фармацевтической отраслям, возможно, придётся пересмотреть свои предложения.
Среди обсуждений в социальных сетях платформы X Джастин Грейс, главный специалист по машинному обучению в LabGenius, поднял вопрос о том, как быстро модели искусственного интеллекта, работающие в режиме «чатов», переходят из частного в открытый доступ.
Для научного сообщества BoltzGen представляет собой расширение и ускорение научных возможностей. «Вопрос, который мне часто задают мои студенты: «Где искусственный интеллект может изменить терапевтическую игру?» — говорит старший соавтор и профессор Массачусетского технологического института Регина Барзилай, руководитель факультета искусственного интеллекта в клинике Джамиля и сотрудник Лаборатории компьютерных наук и искусственного интеллекта (CSAIL).
«Если мы не определим недостижимые мишени для лекарств и не предложим решение, мы не изменим правила игры», — добавляет она. «Акцент здесь делается на нерешённых проблемах, что отличает работу Ханнеса от других в этой области».
Старший соавтор Томми Яаккола, профессор электротехники и компьютерных наук имени Томаса Сибеля, сотрудник клиники Джамиля и CSAIL, отмечает, что «модели, подобные BoltzGen, которые выпускаются в полностью открытом исходном коде, позволяют более широким усилиям сообщества ускорить возможности проектирования лекарств».
Ханнес Стёрк считает, что будущее биомолекулярного дизайна будет перевернуто моделями искусственного интеллекта. «Я хочу создавать инструменты, которые помогут нам манипулировать биологией для решения проблем со здоровьем или выполнять задачи с помощью молекулярных машин, которые мы даже не представляли», — говорит он.
«Я хочу предоставить эти инструменты и позволить биологам представить вещи, о которых они даже не думали раньше».
Предоставлено:
Массачусетский технологический институт
Другие новости по теме
- Микропластик нарушает микробиом кишечника и ферментацию у сельскохозяйственных животных, показывает исследование
- Почему яркие блестящие цвета редки в природе? Эксперимент с искусственными цветами показывает компромисс в восприятии
- Современная жизнь объясняет, почему люди в Чили стали выше и у них увеличились размеры головы по сравнению с их предками.
- Подсчёт лосося с помощью воздушной эко-ДНК — проще простого.
- Растения используют инженерные принципы, чтобы пробиться через твёрдую почву.
- Предки человека: кости стопы наконец-то связаны с нашими ранними предками
- От ингибирования к разрушению: препараты-киназы запускают деградацию белков
- Обширные полевые исследования на острове проливают свет на связь между сушей и морем в Муруа
- Любовь ранит: яркие перья могут подвергать риску жизнь некоторых видов фазанов-самцов
- Действительно ли вредно сводить глаза?
Другие новости на сайте
- Техника «corral» позволяет измерять хрупкие квантовые состояния в гибридах магнитов и сверхпроводников на расстоянии
- Телескоп в Чили сделал потрясающую фотографию космической бабочки
- Tencent Hunyuan выпускает HunyuanOCR: экспертная модель обработки текста из изображений с 1 миллиардом параметров
- GPS мозга не менялся миллионы лет: специализированные нейроны могут быть важны для эволюционного выживания
- Гендерный дисбаланс препятствует справедливому управлению окружающей средой, считают учёные ООН
- Изменение климата может расширить ареалы обитания малярийных комаров, предупреждают исследователи
- Исключительные точки меняют порядок режимов генерации лазерного излучения
- Вежливые роботы в школах побуждают детей отвечать с уважением и сочувствием.
- Доверие общества к науке подрывается из-за языка ООН по изменению климата, говорится в исследовании
- Микропластик нарушает микробиом кишечника и ферментацию у сельскохозяйственных животных, показывает исследование