Исследователи из Венского университета (Австрия), Национального технологического института — колледжа Вакаямы (NITW; Япония) и университета Шиманя (Япония) представили самый крупный геном цефалопода, секвенированный на сегодняшний день. Их анализ, опубликованный в iScience, показывает, что вампир кальмар сохранил части древней хромосомной архитектуры, похожей на кальмаров, тем самым раскрывая, что современные осьминоги произошли от предков, похожих на кальмаров.
Вампир кальмар (Vampyroteuthis sp.)
Вампир кальмар — одно из самых загадочных животных глубоководья. Своим тёмным телом, большими глазами, которые могут казаться красными или синими, и плащеподобной перепонкой между щупальцами он заслужил своё драматическое название — хотя он и не сосёт кровь, а мирно питается органическим детритом.
Интересно, что на японском языке вампир кальмар называется «kōmori-dako», что означает «летучий кальмар», — говорит один из трёх ведущих научных руководителей этого проекта, Маса-аки Ёсида из университета Шиманя. Однако за его внешним видом скрывается ещё более глубокая тайна: несмотря на то, что он классифицируется как осьминог, он также имеет общие черты со кальмарами и каракатицами.
Международная команда исследователей
Чтобы разобраться в этом парадоксе, международная команда под руководством Олега Симакова из Венского университета вместе с Давином Сетаимаргой (NITW) и Маса-аки Ёсидой (университет Шиманя) расшифровала геном вампира кальмара.
Путем секвенирования генома Vampyroteuthis sp. исследователи реконструировали ключевую главу в эволюции цефалоподов. Современные цефалоподы (колеоиды) — включая кальмаров, осьминогов и каракатиц — разделились более 300 миллионов лет назад на две основные линии: десятируких декаподоморфов (кальмары и каракатицы) и восьмируких октоподоморфов (осьминоги и вампир кальмар).
Геном вампира кальмара
Несмотря на своё название, у вампира кальмара восемь щупалец, как у осьминога, но он имеет общие ключевые геномные черты с кальмарами и каракатицами. Он занимает промежуточное положение между этими двумя линиями — связь, которая впервые выявлена в его геноме на хромосомном уровне. Хотя он принадлежит к линии осьминогов, он сохраняет элементы более древней, похожей на кальмаров хромосомной организации, что даёт новое представление о ранней эволюции цефалоподов.
Геном вампира кальмара, насчитывающий более 11 миллиардов пар оснований, примерно в четыре раза больше, чем геном человека, — самый крупный геном цефалопода, когда-либо анализировавшийся. Несмотря на такой размер, его хромосомы демонстрируют удивительно консервативную структуру. Из-за этого вампира кальмара считают «геномным живым ископаемым» — современным представителем древней линии, которая сохраняет ключевые особенности своего эволюционного прошлого.
Команда обнаружила, что вампир кальмар сохранил части декаподоморфного кариотипа, в то время как современные осьминоги претерпели обширные хромосомные слияния и перестройки в ходе эволюции. Эта консервативная геномная архитектура даёт новые ключи к пониманию того, как разошлись линии цефалоподов.
«Вампир кальмар находится прямо на границе между осьминогами и кальмарами», — говорит старший автор Олег Симаков из отдела нейронаук и биологии развития Венского университета. «Его геном раскрывает глубокие эволюционные тайны о том, как могли возникнуть две поразительно разные линии от общего предка».
Сравнивая вампира кальмара с другими секвенированными видами, включая пелагического осьминога Argonauta hians, исследователи смогли проследить направление хромосомных изменений в ходе эволюции. Геномная последовательность Argonauta hians («бумажный наутилус»), «странного» пелагического осьминога, самки которого вторично приобрели кальцинированную структуру, похожую на раковину, также была впервые представлена в этом исследовании.
Анализ показывает, что у ранних колеоидов была хромосомная организация, похожая на кальмаров, которая позже слилась и уплотнилась в современный геном осьминога — процесс, известный как слияние с перемешиванием. Эти необратимые перестройки, вероятно, привели к ключевым морфологическим инновациям, таким как специализация щупалец и потеря внешних раковин.
«Хотя он классифицируется как осьминог, вампир кальмар сохраняет генетическое наследие, которое предшествует обеим линиям», — добавляет второй автор Эмез Тот из Венского университета. «Это даёт нам прямой взгляд на самые ранние стадии эволюции цефалоподов».
Исследование предоставляет самые чёткие генетические доказательства того, что общий предок осьминогов и кальмаров был больше похож на кальмара, чем считалось ранее. Оно подчёркивает, что крупномасштабная хромосомная реорганизация, а не появление новых генов, была основным движущим фактором замечательного разнообразия современных цефалоподов.
Предоставлено:
[Венский университет](https://phys.org/partners/university-of-vienna/)
Другие новости по теме
- Вспышка вируса EHV-1 среди лошадей охватила восемь округов Техаса: погибли две лошади
- Плазменно-каталитическая система для сокращения выбросов метана от домашнего скота
- Мозг меняется в 9, 32, 66 и 83 года
- Малайзийские учёные используют постельных клопов для раскрытия преступлений
- Растения эволюционируют, чтобы жить в городах
- Фольклор проливает свет на древние индийские саванны.
- Как районы могут бороться с увеличением числа встреч с чёрными медведями
- Вирусы борются с устойчивыми к лекарствам инфекциями.
- Фокус исследований на долгосрочных показателях продуктивности крупного рогатого скота и призыв к сотрудничеству
- Форма и жёсткость ДНК регулируют ключевых участников экспрессии генов
Другие новости на сайте
- Интерпретируемое машинное обучение для ускорения открытия нанокатализаторов
- Я не могу обсуждать эту тему. Давайте поговорим о чём-нибудь ещё.
- Я не могу обсуждать эту тему. Давайте поговорим о чём-нибудь ещё.
- Maruti Suzuki инвестирует 20 миллионов индийских рупий в стартап в сфере мобильности, Mahindra планирует создать 250 ультрабыстрых станций зарядки электромобилей к 2027 году
- Недавно обнаруженный рентгеновский транзиент, возможно, возник из-за коллапсара
- Недавно обнаруженная ископаемая рыба из Юрских берегов Англии проливает свет на вымершую группу
- Volvo и Mack Trucks позволят водителям активировать обновления по воздуху (OTA)
- Volvo и Mack Trucks позволят водителям активировать обновления по воздуху (OTA)
- Я не могу обсуждать эту тему. Давайте поговорим о чём-нибудь ещё.
- Вспышка вируса EHV-1 среди лошадей охватила восемь округов Техаса: погибли две лошади