РНК играет жизненно важную роль в экспрессии наших генов и развитии заболеваний. Однако из-за того, что молекулы РНК постоянно меняют форму, понимание их работы долгое время было серьёзной научной задачей.
Исследователи из Института генома Сингапура (ASTAR GIS) и Института биоинформатики ASTAR (A*STAR BII) в сотрудничестве с Загребским университетом разработали RiNALMo — модель искусственного интеллекта (ИИ), которая может «читать» и интерпретировать последовательности РНК как язык. Этот прорыв помогает учёным прогнозировать поведение РНК в организме, что потенциально ускоряет разработку методов лечения, нацеленных на РНК, и основанных на РНК.
Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.
РНК лежит в основе многих современных медицинских инноваций, от мРНК-вакцин до генной терапии. Однако разработка РНК-препаратов или прогнозирование их поведения долгое время были медленными и сложными процессами. RiNALMo решает эту задачу, предлагая мощный новый способ понимания и создания РНК для терапевтического применения.
Изучив «грамматику» РНК более чем из 36 миллионов последовательностей, RiNALMo может предсказывать, как РНК складывается, взаимодействует и функционирует. Эти возможности могут ускорить разработку лекарств за счёт сокращения необходимости в длительных лабораторных экспериментах, а также улучшить разработку вакцин и терапию на основе РНК, позволяя создавать более точные и стабильные молекулы. Кроме того, модель поддерживает инновации в диагностике, показывая, как РНК меняется при заболеваниях.
RiNALMo — крупнейшая в мире языковая модель РНК
RiNALMo была обучена на 36 миллионах последовательностей РНК, что позволило ей ознакомиться с огромным разнообразием биологических данных, и работает на базе 650 миллионов параметров, которые позволяют ей обнаруживать тонкие закономерности, которые более мелкие модели могли бы упустить. Такой масштаб позволяет RiNALMo делать более точные прогнозы о структуре и поведении РНК, помогая учёным получать идеи, для получения которых ранее требовались годы лабораторных работ.
При тестировании RiNALMo продемонстрировала передовые результаты в различных эталонных задачах, превосходя существующие модели ИИ в прогнозировании структуры и функций РНК.
«Представьте себе, что мы учим модель читать иностранный язык через бесчисленные предложения, а затем просим её писать стихи, определять грамматику и рассказывать истории на этом языке. Именно это делает RiNALMo с РНК», — сказал профессор Майл Сикич, помощник директора по ИИ и вычислениям в A*STAR GIS и профессор факультета электротехники и вычислительной техники Загребского университета.
«В ASTAR GIS мы сосредоточены на продвижении границ геномики и ИИ для разработки нового поколения лекарств, нацеленных на РНК или основанных на РНК», — сказал доктор Ван Юэ, исполнительный директор ASTAR GIS и соисследователь проекта RiNALMo.
«RiNALMo продемонстрировала, что можно не только выучить язык РНК, но и использовать это понимание для решения новых задач, от прогнозирования функций до разработки молекул РНК с терапевтическим потенциалом. Это открывает захватывающие возможности для разработки лекарств нового поколения на основе РНК», — сказал доктор Себастьян Маурер-Стро, исполнительный директор A*STAR BII.
Это исследование, проведённое под руководством Сингапура, показывает, как местные инновации могут привести к улучшению моделей ИИ в биологии, расширяя границы возможного в науке о РНК и её применении в реальном мире.
Предоставлено Агентством по науке, технологиям и исследованиям (A*STAR), Сингапур.
Другие новости по теме
- Марганец — палка о двух концах в случае болезни Лайма
- Удлинение вегетационного периода не компенсирует снижение роста лесов из-за засухи, показало исследование
- Тестостерон в запахе тела связан с восприятием социального статуса
- Современные тепловизионные дроны помогают обнаружить скрытые убежища исчезающих коал и поссумов-планигалов
- Когда муравьи-аргентинцы сражаются с шмелями за еду, никто не выходит победителем.
- Богатство генов для улучшения семян обнаружено у «живых ископаемых»
- Жители японских Северных Альп борются с обезьянами, чтобы защитить свои дома и фермы
- Хищник-преcursor крокодила: новый вид ящерицы-охотника
- Будущее кораллов и что могут рассказать нам рентгеновские лучи
- Исследование раскрывает, как растения балансируют адаптивность клеток кожи с стабильностью половых клеток
Другие новости на сайте
- Поиск скрытых источников горных рек
- Расшифровка новых «букв» ДНК для развития медицины и биотехнологий
- Исследование выявило худшее качество воздуха в помещениях у семей из неблагополучных районов и этнических меньшинств
- Новый «сверхмягкий» метод секвенирования устраняет давние недостатки тестов метилирования ДНК при раке
- Project Viva превращает McLaren 750S Spider в рассказ о Лас-Вегасе
- Что такое компостирование человеческих останков?
- Физики выяснили, что тяжёлые атомные ядра не так симметричны, как считалось ранее
- «Среднее по Хуберу» для геометрических данных защищает от шума и выбросов
- Перестройка микробных сетей снижает долгосрочные выбросы углерода из почв при потеплении, показывает десятилетнее исследование
- Марганец — палка о двух концах в случае болезни Лайма