Доказательства на основе ДНК восполняют пробелы в глобальных базах данных по сохранению дикой природы Амазонии

от

Недавние исследования, проведённые международным консорциумом учёных, включая специалистов из Альянса зоопарков Сан-Диего и Музея естественной истории при Национальном университете Майор де Сан-Маркос, открывают многообещающие результаты в области сохранения биоразнообразия с помощью ДНК-баркодирования на месте в перуанской Амазонии.

Измерение биологического богатства Земли в одном из самых отдалённых и богатых биоразнообразием регионов — непростая задача

Перуанская Амазония находится под непосредственной угрозой потери видов из-за пожаров и разрушения среды обитания ещё до их идентификации.

Три недавних исследования, два из которых были опубликованы ранее, а третье — в Scientific Data, подчёркивают острую нехватку генетических данных для видов региона

Согласно исследованиям, 44% птиц и 45% млекопитающих, обитающих в Перу, отсутствуют в крупных мировых базах данных, таких как GenBank, База данных штрихкодов жизни (BOLD) и Figshare.

Ситуация ещё более удручающая в отношении генетических данных, полученных непосредственно из перуанских образцов — с 44% до 4,3% для птиц. Эти значительные пробелы в данных ограничивают возможности специалистов по сохранению видов отслеживать разнообразие видов и реализовывать эффективные стратегии сохранения в регионе с беспрецедентным биоразнообразием.

Цель последней статьи в трилогии — восполнить пробелы в ДНК-баркодировании

Для этого планируется создать новые генетические последовательности из биобанков и провести повторную выборку с помощью метода «захват-перезахват».

«Документирование биоразнообразия — это первый шаг в понимании того, как формируются и функционируют экологические сообщества, что необходимо для разработки эффективных стратегий сохранения, имеющих решающее значение для поддержания экологического баланса и поддержки средств к существованию, зависящих от этих сред», — говорит ведущий автор Памела Санчес Вендизу.

Из-за больших пробелов в генетических справочных базах данных традиционные методы обследования, такие как анализ ДНК окружающей среды, не могут эффективно оценить биоразнообразие региона. В ответ команда создала три лаборатории на месте с использованием портативных технологий секвенирования нанопор для документирования и секвенирования дикой природы Амазонии.

«По мере исчезновения видов биологов всё чаще призывают взять на себя роль историков», — говорит д-р Мриналини Эркенсвик Ватса, учёный из Альянса зоопарков Сан-Диего.

«Традиционные методы ДНК-баркодирования в Перу основывались на сотрудничестве с иностранными партнёрами или сервисами по секвенированию, но наша система на месте позволяет документировать биоразнообразие без экспорта ни одного образца».

«Заполняя пробелы в глобальных генетических библиотеках, мы даём специалистам по сохранению возможность генерировать свои собственные данные и принимать обоснованные решения для борьбы с исчезновением видов. Эти технологии предоставляют местным учёным инструменты для независимой защиты своих экосистем».

С 2018 по 2023 год исследователи создали новые генетические штрихкоды для 1858 образцов, включая первые генетические штрихкоды для 30 видов млекопитающих и 196 видов птиц. Это увеличило представленность перуанских видов в BOLD на 110% для млекопитающих и на 36,5% для птиц.

Успех проекта стал возможен благодаря использованию портативных технологий секвенирования с длинным чтением, которые позволили в режиме реального времени быстро получать и анализировать данные.

Новый подход позволил учёным из Перу и специалистам по охране природы сыграть ключевую роль в управлении своим природным наследием и имеет жизненно важное значение для быстрого реагирования на чрезвычайные ситуации в области сохранения, такие как внезапный рост незаконной торговли дикими животными.

Эти исследования предлагают дорожную карту для спасения некоторых из самых любимых экосистем мира, пока не стало слишком поздно. Судьба многих видов может зависеть от этого решающего сдвига в способах сбора генетических штрихкодов, от того, кто обучен сбору данных и где эти данные обрабатываются.

«Эта инициатива расширяет возможности перуанских научных учреждений по эффективному управлению своими ресурсами биоразнообразия и использованию их, создавая прецедент для стран с ограниченными ресурсами и богатым биоразнообразием по всему миру», — говорит доктор Сезар Арана, ведущий историк природы Музея естественной истории Сан-Маркос.

Значение этого исследования выходит далеко за пределы Амазонии, предлагая модель усилий по сохранению по всему миру и подчёркивая жизненно важную важность генетических исследований на месте в управлении и сохранении биоразнообразия во всём мире.

Среди партнёрских учреждений в этом совместном проекте — Ассоциация охраны Амазонии, Conservación Amazónica-ACCA, Field Projects International, Ассоциация Inkaterra, Национальный университет Майор де Сан-Маркос и Университет Оулу.

Предоставлено Альянсом зоопарков Сан-Диего.

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте