Исследователи из Национальных институтов здравоохранения (NIH) разработали агент искусственного интеллекта (ИИ), работающий на основе большой языковой модели (LLM), который создаёт более точные и информативные описания биологических процессов и их функций при анализе наборов генов. Эта работа опубликована в журнале Nature Methods.
Система GeneAgent
Система, получившая название GeneAgent, перепроверяет свои первоначальные прогнозы (также известные как утверждения) на точность, сверяясь с информацией из установленных баз данных, составленных экспертами, и возвращает отчёт о проверке, в котором подробно описаны её успехи и неудачи.
ИИ-агент может помочь исследователям интерпретировать молекулярные данные, полученные с помощью высокопроизводительных технологий, и выявлять соответствующие биологические пути или функциональные модули, что может привести к лучшему пониманию того, как различные заболевания и состояния влияют на группы генов по отдельности и вместе.
Принцип работы GeneAgent
ИИ-агент GeneAgent перепроверяет свои утверждения, сверяясь с данными из внешних баз, составленных экспертами. Исследовательская группа сначала протестировала GeneAgent на 1106 наборах генов, полученных из существующих баз данных с известными функциями и названиями процессов.
Для каждого набора генов GeneAgent сначала генерирует первоначальный список функциональных утверждений. Затем он независимо использует свой модуль самопроверки, чтобы перепроверить эти утверждения по базам данных, составленным экспертами, и создать отчёт о проверке, в котором указано, подтверждается ли каждое из его утверждений, частично подтверждается или опровергается.
Чтобы определить точность GeneAgent на этапе самопроверки, исследователи привлекли двух экспертов для ручной проверки 10 случайно выбранных наборов генов с общим количеством утверждений 132 и оценки правильности отчётов о самопроверке GeneAgent.
Эксперты определили, что 92% решений GeneAgent были правильными, что свидетельствует о высокой эффективности системы в проведении самопроверки, особенно по сравнению с GPT-4. Детальный анализ подтвердил эффективность модели в минимизации «галлюцинаций» ИИ и создании более надёжных аналитических описаний.
Реальное применение GeneAgent
Исследовательская группа также рассмотрела практическое применение GeneAgent на наборах генов животных-моделей. Применив систему к семи новым наборам генов, полученных из клеточных линий меланомы мышей, GeneAgent смог предложить ценную информацию о новых функциях для конкретных генов. Это может означать открытие новых знаний о потенциальных новых мишенях для лекарств от таких заболеваний, как рак.
Хотя LLM, такие как GeneAgent, всё ещё ограничены объёмом информации, которую они могут использовать, и неспособностью рассуждать как люди, способность GeneAgent к самостоятельной проверке фактов демонстрирует многообещающие результаты в минимизации «галлюцинаций» ИИ.
Предоставлено Национальными институтами здравоохранения.
Другие новости по теме
- Что делать, если осы испортили ваш пикник: руководство учёного по безопасному приёму пищи в присутствии этих насекомых
- Метод картирования позволяет определить связывание белков с ДНК на уровне отдельных клеток
- Изменение «оксисферы» может помочь в борьбе с деоксигенацией прибрежных экосистем
- Оптигенетическая платформа обеспечивает пространственно-временной контроль активности белков и мРНК в живых клетках
- Как учёные изучают жизнь на грани с помощью антарктических морских пауков
- Биомедицинские инженеры создали органоид целого мозга
- Треть канадцев готова открыть свои кошельки ради сохранения водно-болотных угодий.
- Впервые проведено однодневное исследование микробиома почвы на Крите
- «Это чудо природы»: спустя 111 лет это млекопитающее совершило невероятное возвращение
- Новое понимание поможет фагам победить устойчивые к антибиотикам бактерии
Другие новости на сайте
- Планируется запуск SatoshiMeme ($SATOSHI), что означает «возвращение Сатоши Накамото»
- Уличное освещение — не единственный источник светового загрязнения
- Новый материал на основе глины может предложить доступный способ борьбы с загрязнением воды с низкими отходами, используя только солнечный свет.
- Будущие вакцины можно будет вводить с помощью зубной нити
- Снижение воздействия лунной пыли требует совместных усилий и многочисленных испытаний
- Первозданные чёрные дыры могли стать основой для формирования квазаров
- Петерффи: Interactive Brokers работает над потенциальным стейблкоином.
- Потепление арктических озёр может привести к выделению большего количества метана, чем ожидалось
- Что делать, если осы испортили ваш пикник: руководство учёного по безопасному приёму пищи в присутствии этих насекомых
- Более экологичный способ производства азотных удобрений