РНК-переключатели, меняющие форму, регулируют активность генов в клетках

Молекулы РНК не только переносят информацию для кодирования белков, но и могут принимать сложные двумерные и трёхмерные структуры. В частности, одна и та же молекула РНК может переключаться между структурами «включено» и «выключено», модулируя способность рибосом связываться с РНК и транслировать её в белки.

Новое исследование под руководством молекулярного биолога из Университета Гронингена Дэнни Инкарнато и при участии постдокторанта доктора Иваны Боровской выявило сотни таких регуляторных РНК-переключателей в бактериях E. coli и клетках человека. Исследование опубликовано в журнале Nature Biotechnology.

Несколько лет назад Инкарнато разработал метод картирования альтернативных форм, которые принимают молекулы РНК в живых клетках. Используя этот метод, он выявил участки РНК, способные менять форму между двумя различными структурами, каждая из которых имеет своё воздействие.

Инкарнато говорит: «Способность РНК переключаться между альтернативными структурами обычно подразумевает своего рода регуляцию, аналогичную переключателю «включено-выключено»».

Команда Инкарнато использовала этот метод для изучения сложности РНК-структур в живых клетках. Более того, они разработали новый инструмент, который использует эволюционную информацию для выявления функциональных РНК-структурных переключателей с высокой точностью. Они использовали этот инструмент, чтобы обнаружить сотни таких переключателей.

Одним из примеров является переключатель, который реагирует на температуру и помогает бактериям реагировать на холодовой стресс.

По словам Инкарнато, «выявление значительного числа переключателей — это первый шаг. Следующий шаг — найти способы влияния на их функционирование». Например, можно разработать малые молекулы, которые будут модулировать работу этих переключателей, что в конечном итоге может привести к созданию новых методов лечения заболеваний.

Текущее исследование, на завершение которого ушло более трёх лет, основано на шести годах фундаментальных исследований по обнаружению двумерных форм РНК.

«Это революция, к которой вся область стремилась годами», — отмечает Инкарнато.

Предоставлено Университетом Гронингена.

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте

Оставьте комментарий