Метод roll-to-roll упрощает секвенирование ДНК, делая его более быстрым и эффективным

от

Исследователи из институтов Beijing Genomics и IMDEA Nanociencia представили новый метод, который может значительно ускорить процесс и снизить затраты на работу с жидкостями при секвенировании ДНК.

Традиционный подход к секвенированию ДНК

Традиционное секвенирование ДНК основано на использовании проточных камер, где жидкие реагенты многократно закачиваются и выкачиваются для каждой реакции секвенирования. При крупномасштабном секвенировании этот процесс включает погружение кремниевых пластин в реагенты — метод, который хорошо работает в промышленных масштабах, но непрактичен для небольших лабораторий или клинических условий, где размеры образцов ограничены, а высыхание становится проблемой.

Новый подход

Новый подход переворачивает этот процесс с ног на голову. Вместо закачивания жидкостей через камеру исследователи используют метод roll-to-roll, который мягко разрезает жидкость по поверхности. Это значительно повышает эффективность, позволяя быстрее заменять реагенты и используя до 85 раз меньше материала. В результате секвенирование ДНК, которое раньше занимало дни, теперь можно выполнить менее чем за 12 часов со значительно более низкими затратами на реагенты.

Результаты были опубликованы в журнале Nature Methods.

«Это новый способ мышления о работе с жидкостями», — сказал профессор Томас Херманс. «Это классический пример из учебника — идеальная гидродинамическая система с подвижной стенкой. До сих пор она мало использовалась, потому что предыдущие реализации были очень непрактичны. Но с этим подходом roll-to-roll мы сделали эту концепцию из учебника реальностью».

Вклад профессора Херманса был ключевым для рационализации гидродинамики в этой новой системе с использованием численного моделирования для понимания падения давления и эффективности массопереноса по всему устройству.

Этот новый метод может иметь далеко идущие последствия не только для секвенирования ДНК, но и для широкого спектра применений в здравоохранении и не только.

Предоставлено IMDEA Nanociencia

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте