Впервые создана детальная карта бактерий в кишечнике лемура индри: обнаружено 47 новых видов

Совместное исследование впервые определило состав микробиома кишечника индри — лемура, находящегося под угрозой исчезновения и обитающего только на северо-востоке Мадагаскара. Исследование проводилось совместно кафедрой медицины и наук о жизни (MELIS) Университета Помпеу Фабра и Университетом Тренто (Италия).

Помимо определения до 47 ранее неизвестных видов бактерий, исследование показало, что микробиом индри передаётся внутри их социальных групп. Это может иметь значение для сохранения их среды обитания.

Индри (Indri indri), или бабакото на местном языке, — это древесный лемур, эндемичный для Мадагаскара, который обитает в тропических лесах северо-востока острова и питается листьями, фруктами, семенами, цветами, корой и иногда почвой. Согласно Красному списку Международного союза охраны природы (IUCN), индри находится в критической опасности исчезновения из-за утраты среды обитания в результате изменения климата и деятельности человека.

Индри живут небольшими семьями — стабильными социальными группами — от двух до пяти особей. Они моногамны и живут в матриархальном обществе, образуя долгосрочные связи. Взаимодействие между особями разных групп минимально, поскольку каждая группа занимает чётко разграниченную территорию. Кроме того, никогда не удавалось содержать этот вид в неволе.

Исследование, опубликованное в журнале The ISME Journal, проанализировало микробиом фекалий и образцов почвы из регионов, населённых шестью семьями индри. Собрав геномы, исследовательская группа определила 48 видов бактерий, составляющих микробиом индри. Почти все секвенированные виды (47) до настоящего времени не были описаны и специфичны для микробиома этих лемуров.

«Единственный известный вид, который был идентифицирован, — это E. coli, и он был обнаружен в основном в популяциях индри, живущих ближе к районам, часто посещаемым людьми», — объясняет Мирейя Вальес Коломер, исследователь из MELIS-UPF, возглавлявшая исследование.

«Мы обнаружили, что подавляющее большинство видов бактерий в микробиоме индри являются новыми и специфичными для этих лемуров. Таким образом, если индри вымрет, то исчезнут и бактерии, составляющие их микробиом», — отмечает Вальес Коломер.

Кроме того, исследователи определили, что микробиом передаётся между индри одной социальной группы и что они не получают никаких видов из почвы, несмотря на проглатывание почвы.

«Все индри имеют одни и те же виды бактерий, но бактериальные штаммы различаются от одной социальной группы к другой. Каждая „семья“ имеет уникальные бактериальные штаммы, и генетическое расстояние между штаммами коррелирует с расстоянием между популяциями лемуров, которые живут изолированно друг от друга», — отмечает Никола Сегата из Университета Тренто, соруководивший исследование.

Несмотря на то что исследование является предварительным из-за небольшого размера выборки, «мы надеемся, что описание микробиома индри станет ещё одним инструментом для сохранения его всё более фрагментированной среды обитания и поможет сохранить вид от исчезновения», — заключает Сегата.

Предоставлено Университетом Помпеу Фабра — Барселона.

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте