В Австралии появился уникальный инструмент для отслеживания прогресса в секвенировании полных геномов более 250 000 известных и каталогизированных видов.
Сегодня был запущен Genome Tracker — онлайн-сервис, который показывает, что только 2% известных и каталогизированных видов Австралии имели свой геном секвенирован хотя бы один раз.
Онлайн-панель — часть Австралийского справочного атласа генома (ARGA)
Онлайн-панель Genome Tracker является частью платформы ARGA, которая реализуется через Atlas of Living Australia, Bioplatforms Australia, Australian BioCommons и Australian Research Data Commons.
Доктор Кэтрин Холл из CSIRO, руководитель проекта ARGA, сказала, что Genome Tracker — это значительный шаг вперёд в отслеживании, оценке и определении приоритетов в области охвата геномных данных.
«Секвенирование целых геномов растений и животных даёт представление об экологии, биологии сохранения видов, сельском хозяйстве и биобезопасности, — сказала доктор Холл. — Это позволяет нам заглянуть в прошлое, чтобы понять, как виды адаптировались к уникальным ландшафтам Австралии. Genome Tracker ясно показывает, какие части «древа жизни» хорошо представлены, а какие — недостаточно или вовсе отсутствуют».
Genome Tracker помогает исследователям составлять карту существующего геномного охвата и выделять недостаточно представленные области для исследований.
Конечная цель — опубликовать геномы для широкого спектра австралийского биоразнообразия.
«Геномы помогают нам понять адаптивные черты видов — как они уникально адаптировались к своей среде и как они эволюционируют, — сказала доктор Холл. — Высшие ветви на таксономическом древе жизни представляют более древнее геномное расхождение».
Genome Tracker показывает, что эти древние ветви в настоящее время имеют только 32% геномное покрытие. Улучшение их представления углубит наше понимание того, как виды диверсифицировались и эволюционировали с течением времени.
«Это захватывающее время для биологии. Геномы дают нам дорожные карты, чтобы проследить, как жизнь стала такой, какая она есть сегодня, и как мы можем использовать эти знания для её защиты в будущем, — сказала доктор Холл. — Мы можем посмотреть, что привело к изменениям в организмах, и это может помочь предсказать, как виды могут адаптироваться в будущем. По мере изменения экосистем эти данные освещают популяции для мониторинга, сохранения и защиты».
Таксономические дескрипторы, записи о появлении видов и наложение слоёв экотипов позволяют исследователям использовать ARGA для фильтрации и поиска индексированных геномных данных, а также отслеживать каждый вид в Австралии.
Genome Tracker и ARGA используют существующие возможности исследовательской инфраструктуры Atlas of Living Australia (ALA), национальной инфраструктуры данных о биоразнообразии Австралии, которая размещена в CSIRO, национальном научном агентстве.
Предоставлено CSIRO
Другие новости по теме
- Как 2-тонный камень перевозили на лодке 5300 лет назад
- Использование инсектицидов в кормах для крупного рогатого скота для борьбы с мухами «значительно снижает» численность навозных жуков, которые естественным образом контролируют мух
- Космический прорыв: начало новой Солнечной системы
- Кражи собак: что произошло во время пандемии COVID
- Исследователи создали первый собранный геном мягкого клеща.
- Животные испытывают стресс, когда ведут группу против направления большинства, показало исследование
- Учёные обнаружили 332 подводных каньона в Антарктиде
- Учёные обнаружили, что белок альбумин в крови превращает безобидный грибок в опасный патоген
- Почему в Средневековье люди спали в деревянных шкафах — и почему мы больше не используем их
- Данные, полученные на основе анализа информации с 1000 ферм за 13 лет, показывают, что выживание в сельском хозяйстве зависит от гибкости без потери стабильности.
Другие новости на сайте
- Polymarket рассматривает возможность запуска собственной стабильной монеты
- Volcon привлекает 500 миллионов долларов через частное размещение и приобретает 280 биткоинов.
- SharpLink приобретает 79 949 Ethereum, увеличивает резервы до 360 807 ETH
- Питер Шифф, защитник золота, считает, что биткоин лучше подходит для сохранения стоимости, чем эфириум
- Mercurity Fintech привлекла 200 миллионов долларов для казначейства на базе Solana.
- Характеристика топового сверхпроводника
- Характеристика топового сверхпроводника
- Питер Шифф радуется доходности вложений в золотой ETF и критикует биткоин
- Тактовый размер времени
- Представлен Hero HF Deluxe Pro: интеллектуальное и стильное обновление для ежедневных поездок