Новый метод нацеливания на неупорядоченные белки может ознаменовать новую эру в медицине

Учёные открыли новый способ ускорения разработки лекарств и диагностики, нацелившись на часть протеома (совокупность всех белков в организме), которая ранее считалась недоступной для разработки лекарств. Такие мишени часто называют «недосягаемыми» для лекарств.

Белки — это «рабочие лошадки» организма, жизненно важные для разработки лекарств. Когда что-то идёт не так при таких заболеваниях, как рак или диабет, это происходит потому, что один или несколько белков работают не так, как должны. Лекарства обычно связываются с определёнными участками этих белков, чтобы блокировать вредные действия или усиливать полезные.

В настоящее время при поиске новых лекарств исследователи ищут белки со стабильными, неизменными структурами. Однако этот подход упускает из виду белки с внутренне неупорядоченными участками (IDR), которые составляют более 50% протеома. У этих белков нет фиксированной формы, что затрудняет их нацеливание для исследователей. Следовательно, наука может упускать из виду широкий спектр потенциально жизненно важных новых лекарств.

IDR в белках играют решающую роль в нормальных клеточных функциях, а также способствуют развитию многих заболеваний. Однако традиционные подходы к нацеливанию на эти гибкие участки с помощью антител трудоёмки и часто неэффективны.

В статье, опубликованной в журнале Science, исследователи из лаборатории нобелевского лауреата химика Дэвида Бейкера описывают новый метод под названием «логотипы». Эта система использует искусственный интеллект для разработки новых молекул, которые могут связываться с этими сложными участками.

Как это работает? Вместо того чтобы создавать молекулу, которая пытается вписаться в карман постоянно меняющегося белка, связывающие вещества, разработанные с помощью «логотипов», сами становятся карманами, в которые вписываются мишени. Исследователи успешно разработали такие связывающие вещества для 39 неупорядоченных мишеней.

«Наш вычислительный конвейер проектирования позволяет создавать связывающие белки для произвольных неупорядоченных пептидов и белков», — написали исследователи в своей статье. «Хотя нацеливание на неупорядоченные белки было серьёзной проблемой для традиционных методов, мы показываем, что неупорядоченность является преимуществом: разработанный связывающий белок приводит целевую последовательность в привилегированную конформацию, способную к связыванию».

Этот новаторский подход означает, что многие другие белки могут стать мишенями для новых лекарств. Это может помочь ускорить исследования заболеваний, при которых белки с IDR являются значимым фактором, включая рак и нейродегенеративные расстройства, такие как болезнь Альцгеймера.

Успех этой работы — ещё одно доказательство того, что искусственный интеллект и компьютерный дизайн становятся важными инструментами для решения, казалось бы, неразрешимых задач в биологии и медицине.

© 2025 Science X Network

More from Biology and Medical

Источник

Другие новости по теме

Другие новости на сайте

Оставьте комментарий