Несмотря на генетический вклад денисовцев в современных жителей Восточной Азии и Океании, их внешний облик оставался открытым вопросом с момента открытия 15 лет назад.
Недавно проведённое исследование под руководством Фу Цяоми из Института палеонтологии позвоночных и палеоантропологии Китайской академии наук и Цзи Цяна из Хэбэйского геолого-геофизического университета помогло ответить на этот вопрос. Учёные подтвердили, что почти полный череп гоминина, обнаруженный недалеко от Харбина, принадлежит к линии Denisovan. Возраст находки составляет не менее 146 000 лет.
Методы и результаты
Команда разработала метод автоматической идентификации человеческих популяций на основе древних белков, выявив наиболее информативный древний человеческий протеом на сегодняшний день. Они также оптимизировали методы экстракции и разработали биоинформатические алгоритмы для отслеживания эволюции древней ДНК человека из зубного камня плейстоцена.
Учёные успешно извлекли митохондриальную ДНК хозяина из зубного камня харбинского черепа. Результаты подтвердили, что индивид из Харбина принадлежит к ранней митохондриальной линии Denisovan, указывая на широкое распространение денисовцев от Сибири до Северо-Восточного Китая в позднем среднем плейстоцене.
Исследователи провели независимые палеопротеомические анализы и инновационные эксперименты с древней ДНК на черепе из Харбина и его зубном камне. Впервые их выводы убедительно связали почти полный череп с популяцией Denisovan, решив вопрос, который сохранялся с момента первого выявления денисовцев через древнюю ДНК в 2010 году.
Используя новую палеопротеомическую систему, команда проанализировала данные масс-спектрометрии из харбинского черепа, идентифицировав более 308 000 пептидных спектров, более 20 000 пептидов и подтвердив 95 эндогенных белков.
Команда также обнаружила 122 одноаминокислотных полиморфизма (SAP), уникальных для видов Hominidae, подтвердив классификацию индивида из Харбина в род Homo. Примечательно, что они идентифицировали три варианта, уникальные для Denisovan, установив филогенетическую связь между индивидом из Харбина и Denisova 3.
Выводы
Это исследование подчёркивает потенциал зубного камня для сохранения древней ДНК человека, открывая новое окно в генетические исследования гомининов среднего плейстоцена. Две работы не только разрешили споры о классификации черепа из Харбина, но и выявили относительно полную морфологию черепа денисовцев. Они также предоставляют важные ориентиры для идентификации других древних человеческих окаменелостей в Восточной Азии, которые могут принадлежать к линии Denisovan, таких как находки из Дали и Цзиньнюшань.
Предоставлено Китайской академией наук.