Секвенирование генома и будущее южных коробори-квакш: новые горизонты в сохранении исчезающего вида

Усилия по сохранению южного коробори-квакша, находящегося на грани исчезновения

Популяция южных коробори-квакш, находящихся под угрозой исчезновения, сократилась до нескольких особей, и в дикой природе они не размножаются. Однако недавно опубликованные результаты полного секвенирования генома этих животных стали значительным прорывом в усилиях по их сохранению.

«Если позвать южную коробори-квакшу, она ответит», — говорит ведущий автор исследования, доктор Тиффани Кош из Мельбурнского университета. Однако сейчас в среде обитания этих амфибий на горе Косцюшко, самой высокой вершине Австралии, призывы остаются без ответа.

Для народа валгалу вираджури появление «гиака» весной означало, что перевалы освободились от снега и стало возможно путешествовать. Но сейчас высокогорье затихло. Гиак находится на грани полного исчезновения и функционально вымер в дикой природе, став ещё одной жертвой хитридиомикоза, вызванного интродуцированным хитридиовым грибом.

Этот вид способен выжить только при поддержке зоопарков. «Осталась лишь горстка особей», — говорит Кош, и так продолжается уже около 15 лет, но они выживают только благодаря ежегодным реинтродукциям. «Они не размножаются в дикой природе. Они просто как бы существуют».

Южная коробори-квакша обитает на сфагновых болотах в Снежных горах Нового Южного Уэльса. Её яркие цвета предупреждают потенциальных хищников о том, что этот аппетитный на вид кусочек ядовит, и лучше поискать другую закуску. Она не умеет прыгать, как другие лягушки, а рисунок её кожи уникален, как человеческий отпечаток пальца.

Теперь усилия по сохранению этой амфибии приняли новый оборот. Был составлен полный геном южного коробори-квакша.

Геном южного коробори-квакша

«Впервые геном этого вида был секвенирован, и это было непросто из-за его огромных размеров. Мы обнаружили, что у южных коробори-квакш удивительно большие геномы — более чем в три раза больше, чем у человека», — говорит Кош.

Геном, генетическая схема лягушки, будет использоваться для поддержки её сохранения и возможного возвращения в дикую природу путём выявления генов, обеспечивающих устойчивость к болезням.

«Исследование продолжалось почти десять лет и является одним из геномов лягушек высочайшего качества, когда-либо полученных».

В состав исследовательской группы вошли Проект геномов позвоночных при Рокфеллеровском университете (США) и Департамент климатических изменений, энергетики, окружающей среды и воды Нового Южного Уэльса, говорит Кош.

Для составления карты генома был использован образец тканей самца лягушки, выращенной в неволе, включая образцы почек и печени.

Будущее южных коробори-квакш

«К сожалению, выживание южных коробори-квакш зависит исключительно от программ разведения в условиях сохранения, таких как программы, реализуемые в Мельбурнском зоопарке, Хейлсвиллском святилище и Обществе охраны природы Таронга», — говорит Кош.

«Составление карты генома — это первый важный шаг к нашей конечной цели — вернуть этот уникальный и визуально яркий вид на его естественное место в экосистеме. Геном позволяет нам понять, какие гены повышают или понижают восприимчивость к хитридиозу.

Теперь наше внимание направлено на использование полученных знаний для селекционного разведения лягушек, устойчивых к хитридиовому грибу и способных не только выживать, но и процветать в естественной среде без постоянного вмешательства человека».

Геном уже используется. Только что было завершено исследование ассоциации генов, в котором изучалось влияние хитридия на ряд лягушек, представляющих весь спектр генетической изменчивости в оставшейся популяции.

«У нас есть их генетические данные, поэтому мы можем определить участки генов, которые связаны как с восприимчивостью, так и с устойчивостью к грибу».

Источник

Оставьте комментарий